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制造企业和物流企业的WMS系统存在很多的差异化，具体如下：


多机构的管理

多数情况下，企业物流的仓库机构只有一个，而物流企业的仓库机构往往不只一个，所以物流企业的WMS通常都需要多机构的管理。而且和传统的信息系统多机构的支持不一样的地方在于，物流企业的WMS更关注机构与机构间的协同作业问题，比如移库转仓的流程规范与协同作业，中间的运输管理等等。

物料多属性的管理

企业物流的货品基本都有相同的物料属性字段，比如关注体积、颜色、长度、重量、批号等等，一般只是其中2～3项的组合而已，而第三方物流企业的客户是多样化的，所以客户产品的属性也是多样化的，比如进出口冷储行业关注QIC号和证书流水号，医药行业关注生产日期和失效日期，同类型企业也有不同的关注点。所以物流企业信息化需要预留足够的字段来管理这些不同属性。

多种操作流程的支持

企业物流的作业流程一般是固定的，以入库为例，要么需要质检、要么不需要质检，或者就是定义部分物质是免检产品，其他都需要经过质检流程才能上架。但是企业物流面对不同的客户不同的产品，需要根据客户的不同需求，做不同的入库流程定义，满足客户的需求，同时产生物流增值服务。

计费结算的支持

企业物流通常不关注计费结算功能，而在第三方物流企业的WMS反而是关注重点，毕竟第三方物流的所有操作最终结果都是为“结算”服务的。而且物流企业的计费规则复杂多样，按重量、按面积、按存储时间、按托盘数、按仓库类型（低温、常温、无尘等）、按客户、期间天数、打折期…而且是多条件的组合。传统的企业物流的WMS，通常叫“进销存系统”，计费结算通常是对采购订单的付款和销售的收款，付款和收款都是从相关单据中简单的采集数据而已，不需要经过复杂计算，实现技术上不在同一个档次。

优化策略的使用

相对来说，物流企业更关心WMS的优化策略，包括上架策略、出库分配策略以及关联的仓库作业效率分析等等，因为提高物流作业效率就意味着省钱，省钱就意味着赚钱，或者意味着可以容纳更多的客户物质仓管。

接口的复杂性

物流企业的WMS的对外接口主要包括：

（1）客户的ERP系统

（2）各物流节点数据，多种电子文档的导入导出

（3）提供网上查询和操作给关联企业

这些多数是企业物流不太关注的内容。

对运输（配送）的功能要求

第三方物流企业或多或少都涉及到运输或配送服务，所以对这部分的信息有或多或少的需求。

增加了“计费引擎”模块

WMS增加了独有的“计费引擎”模块，为物流计费提供支持。物流行业的计费规则往往非常复杂，比如仓储企业的仓租费用就包括：包仓、重量、托盘数、体积、物料属性、入库时间、期间天数等多个条件的排列组合，同时再加打折、分级价格等等因素，计费引擎的技术含量不亚于ERP的MRP计算。在制造企业中，计费引擎也可以帮助企业进行成本分析，计算仓库的使用成本。